По выводам финансистов, в этом случае в строке 6 "Покупатель" счета-фактуры продавец должен указать наименование агента (комиссионера), а не принципала (комитента).
Письмо Минфина России от 31.01.2013 N 03-07-09/1896
И это вполне логично. Ведь вы можете и не знать, что договор на продажу товара заключен с посредником, а не с конечным покупателем. А даже если и знаете, смущать это вас не должно - оформляйте счет-фактуру на посредника, с которым заключен договор.
Февраль 2013 г.